Gracias a todos por la ayuda, finalmente era con el tsmuxerR
y aqui esta el audio por fin sin perdias:
General
Complete name : D:\00000.track_4352.dts
Format : DTS
Format/Info : Digital Theater Systems
Format profile : MA / Core
File size : 300 MiB
Overall bit rate mode : Variable
Audio
Format : DTS
Format/Info : Digital Theater Systems
Format profile : MA / Core
Mode : 16
Format settings, Endianness : Big
Bit rate mode : Variable
Bit rate : Unknown / 1 509 Kbps
Channel(s) : 2 channels
Channel positions : Front: L R
Sampling rate : 48.0 KHz
Bit depth : 16 bits
Compression mode : Lossless / Lossy
Ahora lo que me pregunto es, al pasarlo a wav (con el UsEac3to) para poderlo editar, usara el HD o el core? es que no quiero perder calidad...
EDITO: Me respondo a mi mismo por si alguien algun dia se encuentra con el mismo problema, segun esta guia:
http://www.mundodivx.org/foro/index.php?topic=40709.0 es necesario tener instalado esto:
DTS-HD puede ser decodificado, usando:
Filtro DirectShow Sonic Cinemaster Audio Decoder 4.3 (software comercial, ya no siguen con su desarrollo)
ArcSoft TotalMedia Theatre (software comercial)
Ambos decodifican los bits perfectamente. Sonic está limitado a 5.1 o 6.1 canales dependiendo del archivo de entrada,
mientras que ArcSoft puede producir hasta 7.1 canales.
Como resultado, ArcSoft es el decodificador por defecto para DTS-HD.
Y bueno, habra que buscarlo piratilla
a ver si tengo suerte, si no mucho me temo que no podra sacar el HD de ese audio...